由于组培苗的生产从瓶装到瓶装都是在无菌条件下进行的，因此建设组培室进行生产时，通常通过购买多少超净工作台来进行测量。原则上，根据繁殖品种的不同，一个超洁净工作台每年可以生产15-20万苗。计划生产量达到500万株的组培室时，需要配备25-30个无菌操作位置。根据接种者的熟练度、培养周期的长度、污染比例的大小等原因，具体的估算也有弹性。

另外一种计算方法是根据市场需求规律，按最高供应季节需求量除以月生产量来确定必须购置的无菌工作台数量。

当工作台数量确定后，才能设计无菌工作台的摆放方式，计算出组培室的需求面积。按日生产组培苗瓶数及培养期，结合周转期计算需要的培养架数量，以此为基础很容易就可以计算出培养室需求面积。

一般一台无菌工作台，需配备培养架7-10个(1.25mx0.5m×1.8m×6层)，无菌操作室与培养室的面积比例为1：4，或者根据培养架数量确定培养室面积，一般每个培养架需要1.5个平米。当然具体还需要考虑到通道，搬运等情况，可根据自身的情况进行微调以及后期的扩展。

围绕组培室建设，其他必备的配套设备及操作用具购置的数量，应以每个无菌工作台的需求量计算，解剖刀、镊子、刀片等常用工具还要有充足的备用量。试管苗出瓶、移栽需要安排在过渡培养温室或大棚内进行。

现代组培室还需要建设某种资源保存园、原种、原种园、生产性栽培展示区等，其面积的大小要根据植物的种类而定，当然大规模的生产企业会考虑。